Aplicación del modelo de programación CUDA en la simulación de la evolución de secuencias genéticas

  • Freddy Yasmany Chávez Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas
  • Daniel Gálvez Lio Universidad Metropolitana del Ecuador
Palabras clave: simulación, evolución molecular, Markov, programación paralela, CUDA

Resumen

La simulación resulta un poderoso enfoque en el estudio de la evolución molecular de secuencias genéticas y su divergencia a lo largo del tiempo; existen diferentes procedimientos de simulación de la evolución molecular, pero todos ellos poseen alta complejidad computacional, y en la mayoría de los casos las secuencias genéticas poseen gran tamaño, aumentando los tiempos de ejecución de las implementaciones de estos procedimientos. A partir de esta problemática, en este trabajo se describe una propuesta de modelo de paralelización utilizando la tecnología CUDA y los resultados de esta propuesta se comparan con su equivalente secuencial.

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Publicado
2017-03-31
Cómo citar
Yasmany Chávez, F., & Gálvez Lio, D. (2017). Aplicación del modelo de programación CUDA en la simulación de la evolución de secuencias genéticas. Enfoque UTE, 8(2), pp. 78 - 93. https://doi.org/https://doi.org/10.29019/enfoqueute.v8n2.159
Sección
Ingeniería General